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5])) # Nombre d'éléments supérieur à 1, 5 2015-07-08
lapply ( X = iris, function (x) class (x)) ## $ ## [1] "numeric" ## $Species ## [1] "factor" lapply ( X = colnames (iris), function (x) summary (iris[, x])) ## [[1]] ## Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. ## 4. 300 5. 100 5. 800 5. 843 6. 400 7. 900 ## [[2]] ## 2. 000 2. 800 3. 000 3. 057 3. 300 4. 400 ## [[3]] ## 1. 000 1. 600 4. 350 3. 758 5. 100 6. 900 ## [[4]] ## 0. 100 0. 300 1. 199 1. 800 2. 500 ## [[5]] ## setosa versicolor virginica ## 50 50 50 Quand on regarde de plus près, on se rend compte, que ces fonctions peuvent jouer le même rôle qu'une boucle. lapply ( X = colnames (iris), function (x) x) ## [1] "" ## [1] "Species" Fonction sapply La fonction sapply est similaire à la fonction lapply sauf qu'elle ne retourne pas de liste mais un vecteur ou une matrice. sapply ( X = iris, function (x) class (x)) ## "numeric" "numeric" "numeric" "numeric" "factor" Fonction tapply La fonction tapply adopte la même approche que la fonction aggregate. Comment appliquer une fonction à une liste ? : lapply ; sapply ? - Astuces et scripts R. Elle permet d'agréger des données. Les arguments de la fonction d'agrégation sont renseignés dans la fonction tapply et non dans la fonction d'agrégation.
Nous créons une fonction nommée avg pour calculer la moyenne du minimum et du maximum du vecteur. avg <- function(x) { ( min(x) + max(x)) / 2}fcars <- sapply(dt, avg)fcars Sortie ## speed dist## 14. 5 61. 0 La fonction sapply() est plus efficace que lapply() dans la sortie retournée parce que sapply() stocke les valeurs directement dans un vecteur. Lapply sous r sistible ascension du. Dans l'exemple suivant, nous verrons que ce n'est pas toujours le cas. Nous pouvons résumer la différence entre apply(), sapply() et `lapply() dans le tableau suivant: lapply Fonction Arguments Objectif. Entrée apply apply(x, MARGIN, FUN) Appliquer une fonction aux lignes ou aux colonnes ou aux deux Cadre de données ou matrice vecteur, liste, tableau lapply(X, FUN) Appliquer une fonction à tous les éléments de l'entrée Liste, vecteur ou cadre de données liste sappy sappy(X FUN) vecteur ou matrice Trancher un vecteur Nous pouvons utiliser lapply() ou sapply() de manière interchangeable pour trancher un cadre de données. Nous créons une fonction, below_average(), qui prend un vecteur de valeurs numériques et renvoie un vecteur qui ne contient que les valeurs strictement supérieures à la moyenne.
Quelqu'un sait-il comment faire ceci? En vous remerciant de votre attention Matthieu FARON Aline Deschamps Messages: 133 Enregistré le: 11 Mai 2010, 07:49 Contact: Message par Aline Deschamps » 21 Fév 2011, 15:38 Peut-être qu'un code réproductible et minimal serait le bienvenu ici. En effet, en ce qui me concerne je ne vois pas bien à quel moment vous faîtes appel au lapply (la commande paste est-elle incluse dans la fonction utilisée dans le lapply? ). Cordialement, A. D. Message par matthieu faron » 21 Fév 2011, 15:49 Merci de votre réponse. Voici le code en question: Code: Tout sélectionner #la fonction uni1 <- function(var) { survie <- survfit(Surv(delaios, status) ~ var, data=don) lr <- survdiff(Surv(delaios, status) ~ var, data=don) test <- round(pchisq(lr$chisq, df = (dim(lr$n)-1), ), 5) out <- list("Survie"=survie, "Log Rank"=test) if (test<0. Titre d'un graphique appelé par fonction et lapply - Groupe des utilisateurs du logiciel R. 05) { survplot(survie) titre <- paste("Overall Survival:", substitute(var)) print(titre) text(titre[3], xpd=T, x=12, y=1. 1, font=2)} return(out)} # l'appel à lapply lapply(listuni1, FUN=uni1) # la liste (enfin le debut) listuni1 <- list("Site du primitif" = don$primsite, "Loc double" = don$pdouble,... ) En vous remerciant à nouveau pour votre attention Logez Maxime Messages: 3061 Enregistré le: 26 Sep 2006, 11:35 Message par Logez Maxime » 21 Fév 2011, 16:06 enlève le substitute et ça devrait fonctionner.
La lettre l devant le apply correspond à ` list` Par défaut, les résultats sont également fournis sous forme d'une liste: maliste <- list(E1=rnorm(10), E2=1:10, E3=runif(10)) maliste ## $E1 ## [1] -1. 7984349 0. 6276849 0. 7310556 1. 1642278 -1. 0313113 0. 1958217 ## [7] -1. 9018991 -1. 8122020 -0. 3482781 -1. 2713203 ## ## $E2 ## [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ## $E3 ## [1] 0. 723830546 0. 838541188 0. 845484439 0. 039995958 0. R pour les nuls: La fonction tapply(). 615807877 0. 917093245 ## [7] 0. 867372951 0. 224336368 0. 001643635 0. 081938347 lapply(maliste, mean) ## [1] -0. 5444656 ## [1] 5. 5 ## [1] 0. 5156045 Si on utilise une fonction qui nécessite des arguments, il faut les indiquer après la fonction, comme ici avec la fonction quantile() et l'argument probs. lapply(maliste, quantile, probs=c(0. 25, 0. 75)) ## 25% 75% ## -1. 6666563 0. 5197191 ## 3. 25 7. 75 ## 0. 1175379 0. 8437486 On peut également obtenir les résultats sous la forme d'un vecteur en employant la fonction unlist() en amont: unlist(lapply(maliste, mean)) ## E1 E2 E3 ## -0.
Fonction lapply() La fonction lapply() est utile pour effectuer des opérations sur des objets de liste et renvoie un objet de liste de même longueur que l'ensemble d'origine. lappy() renvoie une liste de longueur similaire à l'objet de liste d'entrée, dont chaque élément est le résultat de l'application de FUN à l'élément correspondant de la liste. lapply() prend une liste, un vecteur ou un cadre de données en entrée et donne une sortie en liste. lapply(X, FUN)Arguments:-X: A vector or an object-FUN: Function applied to each element of x l dans lapply() représente la liste. La différence entre lapply() et apply() réside dans le retour de sortie. Le retour de lapply() est une liste. Lapply sous l'emprise. lapply() peut être utilisé pour d'autres objets comme les cadres de données et les listes. La fonction lapply() n'a pas besoin de MARGIN. Un exemple très simple peut être de changer la valeur de la chaîne de caractères d'une matrice en minuscule avec la fonction tolower. Nous construisons une matrice avec le nom des films célèbres.
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